Ведущий автор исследования объясняет: «Наши результаты показали, что в организме человека может быть несколько различных вариантов вируса. Некоторые из этих вариантов могут использовать клетки почек или селезенки в качестве ниши для укрытия».
Непрерывная серия вариантов полностью заменила исходный вирус к настоящему времени, при этом Omicron и Omicron 2 доминируют во всем мире. Фото: pixabay.com
Люди, страдающие от COVID-19, могут иметь несколько различных вариантов SARS-CoV-2, скрытых от иммунной системы в разных частях тела, говорится в новом исследовании, опубликованном в Nature Communications международной исследовательской группой. Авторы исследования говорят, что это может значительно затруднить полное удаление вируса из организма инфицированного человека с помощью его собственных антител или терапевтического лечения антителами, пишет medicalxpress.com.
COVID-19 продолжает распространяться по миру, вызывая госпитализации и смерти, нанося ущерб обществу и экономике во всем мире. Последующие вызывающие озабоченность варианты (VoC) заменили исходный вирус из Уханя, все чаще избегая иммунной защиты, обеспечиваемой вакцинацией или лечением антителами.
В новом исследовании, включающем два исследования, опубликованные параллельно в Nature Communications, международная группа под руководством профессора Имре Бергера из Бристольского университета и профессора Иоахима Спатца из Института медицинских исследований Макса Планка в Гейдельберге, оба директора Бристольского центра Макса Планка Минимальной биологии, показать, как вирус может отчетливо развиваться в разных типах клеток и адаптировать свой иммунитет к одному и тому же инфицированному хозяину.
Команда стремилась исследовать функцию специально созданного кармана в спайковом белке SARS-CoV-2 в инфекционном цикле вируса. Карман, обнаруженный бристольской командой в более раннем прорыве, сыграл важную роль в вирусной инфекционности.
«Непрерывная серия вариантов полностью заменила исходный вирус к настоящему времени, при этом Omicron и Omicron 2 доминируют во всем мире». сказал профессор Имре Бергер. «Мы проанализировали ранний вариант, обнаруженный в Бристоле, BrisDelta. Он изменил свою форму по сравнению с исходным вирусом, но карман, который мы обнаружили, остался там без изменений». Интересно, что BrisDelta представлен в виде небольшой субпопуляции в образцах, взятых у пациентов, но, по-видимому, заражает определенные типы клеток лучше, чем вирус, который доминировал в первой волне инфекций.
Доктор Капил Гупта, ведущий автор исследования BrisDelta, объясняет: «Наши результаты показали, что в организме человека может быть несколько различных вариантов вируса. Некоторые из этих вариантов могут использовать клетки почек или селезенки в качестве ниши для укрытия, в то время как тело заняты защитой от доминирующего типа вируса. Это может затруднить полное избавление инфицированных пациентов от SARS-CoV-2».
Команда применила передовые методы синтетической биологии, современные изображения и облачные вычисления, чтобы расшифровать вирусные механизмы в действии. Чтобы понять функцию кармана, ученые создали в пробирке синтетические вирионы SARS-CoV-2, которые имитируют вирус, но имеют большое преимущество в том, что они безопасны, поскольку не размножаются в клетках человека.
Используя эти искусственные вирионы, они смогли изучить точный механизм кармана при вирусной инфекции. Они продемонстрировали, что при связывании жирной кислоты шиповидный белок, украшающий вирионы, меняет свою форму. Этот механизм переключения «формы» эффективно скрывает вирус от иммунной системы.
Доктор Оскар Штауфер, ведущий автор этого исследования и совместный сотрудник Института Макса Планка в Гейдельберге и Центра Макса Планка в Бристоле, объясняет: менее заметным для иммунной системы. Это может быть механизмом, позволяющим избежать обнаружения хозяином и сильным иммунным ответом в течение более длительного периода времени и повысить общую эффективность инфекции».
«Похоже, что этот карман, специально созданный для распознавания этих жирных кислот, дает SARS-CoV-2 преимущество внутри тела инфицированных людей, позволяя ему так быстро размножаться. Это может объяснить, почему он присутствует во всех вариантах, включая Омикрон», — добавил профессор Бергер. «Интересно, что та же самая функция также дает нам уникальную возможность победить вирус именно потому, что он настолько консервативен — с помощью специально разработанной антивирусной молекулы, которая блокирует карман». Halo Therapeutics, недавнее дочернее предприятие Бристольского университета, основанное авторами, придерживается именно такого подхода к разработке противовирусных средств против коронавируса.